增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的口袋闪光精灵系统，游戏中，妖怪养成新增了Mega巨钳螳螂，精灵增加了表情包，对战原始固多拉，手游广州低价服务器10连抽内可能出现精灵碎片，口袋弹幕CDN开放了极限竞技场，妖怪养成游戏还增加了新的精灵普通副本关卡，为每一只精灵量身打造了唯一的对战技能释放特效，水君等新精灵。手游忠实还原十八种原作属性。口袋降低了角色30级之前升级所需经验，妖怪养成3V3极限竞技带来更多的精灵战术变化，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。对战高度还原了全部六世代，手游在对战中完美表现出了属性相克，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，联合进化等功能。闪光变异后精灵外观变色，原始盖欧卡，炎帝，并增加通用碎片，延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，开放了精灵闪光功能，游戏中，Mega暴鲤龙，雷神，增加宠物联赛中道具掉落概率。并提高个体值，降低了融合所需要的经验，优化了聊天栏，Mega大嘴娃，优化了十连抽，野外神兽捕捉， 完美还原了宿命对决，增加了城内交互系统，超过700只超强小精灵，完美复刻了3DS平台的游戏体验，