延续了原作中精灵收集与养成的口袋核心玩法，Mega大嘴娃，妖怪养成并提高个体值，精灵优化了十连抽，对战在对战中完美表现出了属性相克，手游游戏VPS完美还原了宿命对决，口袋广州SSD服务器增加了表情包，妖怪养成并增加通用碎片，精灵降低了融合所需要的对战经验，游戏还增加了新的手游普通副本关卡，增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的口袋闪光精灵系统，优化了聊天栏，妖怪养成原始固多拉，精灵完美复刻了3DS平台的对战游戏体验，开放了极限竞技场，手游雷神，高度还原了全部六世代，新增了Mega巨钳螳螂，增加了城内交互系统，原始盖欧卡，降低了角色30级之前升级所需经验，超过700只超强小精灵，忠实还原十八种原作属性。游戏中，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。炎帝， 游戏中，野外神兽捕捉，联合进化等功能。3V3极限竞技带来更多的战术变化，为每一只精灵量身打造了唯一的技能释放特效，水君等新精灵。10连抽内可能出现精灵碎片，增加宠物联赛中道具掉落概率。开放了精灵闪光功能，闪光变异后精灵外观变色，Mega暴鲤龙，